Wyszukiwanie zaawansowane ?

Obiekt

Pobierz

Tytuł: Selecting differentially expressed genes for colon tumor classification

Autor:

Fujarewicz, Krzysztof ; Wiench, Małgorzata

Data wydania:

2003

Typ zasobu:

artykuł

Współtwórca:

Kimmel, Marek - red. ; Lachowicz, Mirosław - red. ; Świerniak, Andrzej - red.

Podtytuł:

Cancer Growth and Progression, Mathematical Problems and Computer Simulations

Tytuł publikacji grupowej:

AMCS, volume 13 (2003)

Abstract:

DNA microarrays provide a new technique of measuring gene expression, which has attracted a lot of research interest in recent years. It was suggested that gene expression data from microarrays (biochips) can be employed in many biomedical areas, e.g., in cancer classification. ; Although several, new and existing, methods of classification were tested, a selection of proper (optimal) set of genes, the expressions of which can serve during classification, is still an open problem. Recently we have proposed a new recursive feature replacement (RFR) algorithm for choosing a suboptimal set of genes. ; The algorithm uses the support vector machines (SVM) technique. In this paper we use the RFR method for finding suboptimal gene subsets for tumor/normal colon tissue classification. The obtained results are compared with the results of applying other methods recently proposed in the literature. ; The comparison shows that the RFR method is able to find the smallest gene subset (only six genes) that gives no misclassifications in leave-one-out cross-validation for a tumor/normal colon data set. In this sense the RFR algorithm outperforms all other investigated methods.

Wydawca:

Zielona Góra: Uniwersytet Zielonogórski

Identyfikator zasobu:

oai:zbc.uz.zgora.pl:59045

Strony:

327-335

Źródło:

AMCS, volume 13, number 3 (2003) ; kliknij tutaj, żeby przejść

Jezyk:

eng

Prawa do dysponowania publikacją:

Biblioteka Uniwersytetu Zielonogórskiego

Temat i słowa kluczowe:

colon tumor gene expression data microarrays support vector machines feature selection classification

Kolekcje, do których przypisany jest obiekt:

Data ostatniej modyfikacji:

2021-10-18

Data dodania obiektu:

2021-10-18

Liczba wyświetleń treści obiektu:

78

Wszystkie dostępne wersje tego obiektu:

https://zbc.uz.zgora.pl/publication/65907

Wyświetl opis w formacie RDF:

RDF

Wyświetl opis w formacie OAI-PMH:

OAI-PMH

Nazwa wydania Data
Selecting differentially expressed genes for colon tumor classification 2021-10-18

Obiekty

Podobne
AMCS, volume 11 (2001)
AMCS, volume 11 (2001)

Rough sets methods in feature reduction and classification

Świniarski, Roman W. Grzymala-Busse, Jerzy - ed. Świniarski, Roman W. - ed. Zhong, Ning - ed. Ziarko, Wojciech - ed.

2001
artykuł
AMCS, Volume 26 (2016)
AMCS, Volume 26 (2016)

Using the one-versus-rest strategy with samples balancing to improve pairwise coupling classification

Chmielnicki, Wiesław Stąpor, Katarzyna Korbicz, Józef (1951- ) - red. Uciński, Dariusz - red.

artykuł
AMCS, Volume 24 (2014)
AMCS, Volume 24 (2014)

A primal sub-gradient method for structured classification with the averaged sum loss

Mančev, Dejan Todorović, Branimir Korbicz, Józef (1951- ) - red. Uciński, Dariusz - red.

2014
artykuł
AMCS, Volume 16 (2006)
AMCS, Volume 16 (2006)

Correlation-based feature selection strategy in classification problems

Michalak, Krzysztof Kwaśnicka, Halina Korbicz, Józef (1951- ) - red. Uciński, Dariusz - red.

2006
artykuł
AMCS, Volume 24 (2014)
AMCS, Volume 24 (2014)

Data mining methods for gene selection on the basis of gene expression arrays

Muszyński, Michał Osowski, Stanisław Abaev, Pavel - ed. Razumchik, Rostislav - ed. Kołodziej, Joanna - ed.

2014
artykuł
AMCS, Volume 24 (2014)
AMCS, Volume 24 (2014)

A differential evolution approach to dimensionality reduction for classification needs

Martinović, Goran Bajer, Dražen Zorić, Bruno Kowal, Marek - red. Korbicz, Józef (1951- ) - red.

2014
artykuł
AMCS, volume 13 (2003)
AMCS, volume 13 (2003)

Properties of a singular value decomposition based dynamical model of gene expression data

Simek, Krzysztof Kimmel, Marek - red. Lachowicz, Mirosław - red. Świerniak, Andrzej - red.

2003
artykuł
AMCS, Volume 24 (2014)
AMCS, Volume 24 (2014)

Multiple-instance learning with pairwise instance similarity

Yuan, Liming Liu, Jiafeng Tang, Xianglong Abaev, Pavel - ed. Razumchik, Rostislav - ed. Kołodziej, Joanna - ed.

2014
artykuł
Więcej

Dane kontaktowe

Adres

Biblioteka Uniwersytetu
Zielonogórskiego
al. Wojska Polskiego 71
65-762 Zielona Góra

Telefon

(+48) 68 328 21 55

E-Mail

kontakt@zbc.uz.zgora.pl

Wojewódzka i Miejska Biblioteka Publiczna
im. C. Norwida w Zielonej Górze
al. Wojska Polskiego 9
65-077 Zielona Góra

(+48) 68 453 26 06

p.karp@biblioteka.zgora.pl

Ta strona wykorzystuje pliki 'cookies'. Więcej informacji